Джудд Апатоу родился 6 декабря 1967 года в Флашинге, Куинс, а вырос в Сайоссете, Нью-Йорк. Семья Джудда еврейского происхождения. У Апатоу есть старший брат Роберт и младшая сестра Миа. Когда Джудду было двенадцать лет , его родители развелись. После этого Апатоу в основном жил с отцом, а мать посещал на выходных.

Во время учебы в средней школы Апатоу на школьной радиостанции вел программу под названием «Comedy Club». Для своей программы он сумел взять интервью у многих знаменитых комиков.

После окончания школы Джудд Апатоу поступил в Университет Южной Калифорнии на специальность сценариста. Он подрабатывал стенд-ап комиком в сериале «Comic Strip Live», прежде чем понял, что он может намного больше. И Джудд начал писать для комиков, таких как Розанна Барр, Джим Керри и Том Арнольд, а в 1992 году занял должность руководящего продюсера сериала «Шоу Бена Стиллера». Хотя шоу существовало в течение одного сезона, но за сценарии Апатоу получил Эмми.

С 1993 по 1998 год на протяжении нескольких сезонов Джудд Апатоу был одним из сценаристов и исполнительным продюсером «Шоу Ларри Сандерса». За свою работу над шоу Апатоу получил шесть номинаций «Эмми».

Следующим проектом Джудда стал сериал «Чудики и чокнутые», премьера которого состоялась в 1999 году.

К середине 90-х годов Апатоу также начинает работать над созданием фильмов. В 1996 году на экраны вышли комедии «Баскетбольная лихорадка» и «Кабельщик», в которых Джудд выступил в качестве исполнительного продюсера и сценариста.

В августе 2005 года состоялся режиссерский дебют Джудда Апатоу в полнометражной картине «Сорокалетний девственник» со Стивом Кэреллом. Фильм стал хитом и заработал почти 110 миллионов долларов на внутреннем прокате и еще $ 68 млн за рубежом. Следующим фильмом Апатоу стала комедия «Немножко беременна», в главных ролях Сет Роген и Кэтрин Хейгл. Фильм имел колоссальный успех и заработал $ 219 млн. по всему миру.

В дополнение к режиссуре Апатоу стал продюсером и/или сценаристом для ряда полнометражных фильмов, в том числе «Телеведущий» (2004), «Суперперцы» (2007), «Не шутите с Зоханом» ( 2008), «Сводные братья» (2008), «Побег из Вегаса» (2010) и «Девичник в Вегасе» (2011), «Телеведущий 2: И снова здравствуйте» (2013).

На данный момент Джудд Апатоу начал работу над новой комедией «Неудачница», выход которой планируется в 2015 году.