У Джейсона Судейкис есть две сестры, Линдси и Кристин. Линдси работает преподавателем в Доминиканской академии в Нью-Йорке. Кристин является признанным хореографом и танцовщицей в Нью-Йорке и не одиножды появлялась эпизодических ролях в сериале «30 потрясений».

Судейкис был женат. В 2004 году он после длительных отношений женился на актрисе и сценаристке сериала «30 потрясений» Кэй Кэннон. Пара разлучилась в 2008 году, а развелись в 2010 году. После развода, Джейсон встречался с актрисой Дженьюари Джонс, которою он встретил на шоу «Субботним вечером в прямом эфире».

В 2011 году он начал встречаться с актрисой Оливией Уайлд.

12 января 2013 года пара объявила о своей помолвке.