Роберто Манчини женат на Федерике Морелли, у него одна дочка, Камилла, и два сына, Филиппо и Андреа.

Филиппо, воспитанник школы «Интера» 17 января 2008 года дебютировал в Кубке Италии за клуб, затем был арендован «Манчестер Сити». В 2009 году оба сына перешли в клуб «Монца».

С 2010 года Андреа, младший и более одаренный футболист, вошел в состав «Манчестер Сити».

В 2008 году Манчини купил пятизвёздочный отель на острове Сардиния, открытие состоялось в 2009 году.