Хейден Кристенсен родился 19 апреля 1981 года в Ванкувере (Канада), в семье программиста и спичрайтера. Ранние годы актёр провёл в Торонто, посещая местную школу. Хейден – один из четверых детей в семье Кристенсен. В детстве актёр прекрасно играл в хоккей и теннис. Кинодебют Кристенсена состоялся случайно: однажды он пошёл на встречу с агентом вместе со старшей сестрой, и тот предложил маленькому Хейдену попробовать свои силы на актёрском поприще. Так постепенно Хейден Кристенсен стал участвовать в съёмках рекламы, а уже в 1993 году он получил свою первую роль в телевизионном фильме «Семейные страсти».

По окончании школы мальчик усиленно занимался поиском работы в кино. Так он получил роль в подростковой картине «Strike!», в которой его партнёршами стали актрисы Кирстен Данст и Рейчел Лей Кук. Одновременно со съёмками в кино Хейден принимал участие в различных детских ТВ-программах.

В 1999 году он принял участие в дебютном проекте Софии Копполы, дочери легендарного американского кинорежиссёра Фрэнсиса Форда Копполы, «Девственницы-самоубийцы». Несмотря на то, что у Хейдена была второстепенная роль, его заметили, и после этого молодой актёр снялся в сериале «Высоты», с которого и началась его успешная кинокарьера. В этой драме Хейден блестяще сыграл подростка-наркомана по имени Скотт, который подвергся сексуальным притязаниям со стороны своей мачехи. Это была первая главная роль Хейдена, благодаря которой он прославился. Затем на экраны вышел фильм «Жизнь, как дом» (2001), в котором Хейден Кристенсен сыграл второстепенную роль.

За исполнение этой роли молодой актёр впервые был номинирован на премию «Золотой глобус».

Вероятно, успех Хейдена Кристенсена не был бы таким большим, если бы волею случая он не оказался в актёрском составе знаменитой фантастической саги «Звёздные войны» Джорджа Лукаса. Во второй части киноэпопеи «Звёздные войны: Атака клонов» Хейден сыграл роль юного Энакина Скайуокера, который впоследствии стал самым знаменитым злодеем саги Дартом Вейдером.

Известно, что на роль в этом фильме претендовало около 400 кандидатов.

Первоначально на роль Скайуокера рассматривался даже знаменитый киноактёр Леонардо ДиКаприо, но Джордж Лукас выбрал малоизвестного канадского актёра Хейдена Кристенсена.

В одном из интервью актёр признался: «Когда мне позвонил Лукас, я был в Ванкувере, мне только-только исполнилось девятнадцать лет. Я ушам не поверил. Думаю, до сих пор это остаётся счастливейшим моментом моей жизни, ничто с этим не сравнится. Потрясающая удача – получить такую роль».

В мае 2000-го года Джордж Лукас утвердил Кристенсена на роль, заявив, что, доволен тем, как актёры взаимодействуют на площадке, подразумевая дуэт Хейден Кристенсен и Натали Портман.

После выхода картины на экран журнал People включил Хейдена Кристенсена в список «50 самых красивых людей мира».

После «Звёздных войн» актёр стал невероятно популярным, и журналисты просто не давали ему прохода. Следующей картиной молодой звезды Голливуда стал фильм «Афера Стивена Гласса», в которой он сыграл журналиста Стивена Гласса, прославившегося своими фальшивыми статьями. Затем последовало продолжение фантастической саги Лукаса «Звёздные войны: Месть Ситхов», в котором Энакин Скайуокер становится правой рукой Тёмного Императора – Дартом Вейдером.

После этого Хейден принял участие в фильме о знаменитом американском художнике Энди Уорхоле, создателе стиля поп-арт, и его молодой музе Иди Седжвик, которую сыграла американская актриса Сиенна Миллер. В картине «Как я соблазнила Энди Уохола» Хейден сыграл музыканта, прообразом которого стал знаменитый американский рок-музыкант, поэт и композитор Боб Дилан. Значимыми работами в кинокарьере актёра стали фильмы: «Наркоз» (2007), «Телепорт» (2008), «Нью-Йорк, я люблю тебя» (2008).

В 2010 году с участием актёра вышел криминальный боевик «Налётчики» (2010), также фантастический триллер «Исчезновение на 7-й улице» (2010).

В 2014 году Хейден Кристенсен исполнил главные роли в фильмах «В изгнании» и «Ограбление по-американски».

В сентябре 2015 года Хейден вместе с Кейт Босворт появился в драме «90 минут на небесах».