С ноября 2011 года Шарлотта Казираги живет в гражданском браке с еврейским франко-марокканским актером и комиком Гадом Эльмалехом. У пары есть сын — Рафаэль Эльмалех, который родился 17 декабря 2013 года.

Шарлотта Казираги ежегодно посещает Bal de la Rose, организуемый фондом принцессы Грейс Келли, на котором собираются средства в помощь бедным больным детям.