Кларенс Клайд Зеедорф родился 1 апреля 1976 года в Парамарибо в семье бывшего футболиста Йоганна Зеедорфа. Кроме Кларенса в семье выросли еще двое сыновей – Юрген и Чедрик.

Когда Кларенсу исполнилось 2 года, вся семья переехала в нидерландский город Алмере. В возрасте 6 лет Кларенс начал заниматься в футбольной школе клуба «VV AS '80», а спустя год он перешел в «Реал Альмере».

В 1984 году юный Зеедорф попал в футбольную школу амстердамского «Аякса», в которой занимался до своего профессионального дебюта.

В 1992 году Кларенс Зеедорф подписал свой первый профессиональный контракт с «Аяксом», где сразу же стал попадать в основной состав.

По итогам 1993 и 1994 годов Кларенс становился лучшим молодым футболистом Голландии.

В 1994 и 1995 годах Кларенс Зеедорф вместе с «Аяксом» ставал победителем Чемпионата Нидерландов и победителем Лиги Чемпионов УЕФА 1995.

В том же 1994 году Зеедорф дебютировал за сборную Нидерландов.

В начале сезона 1995/1996 Кларенс подписал контракт с «Сампдорией». За итальянский клуб футболист отыграл 32 матча, в которых забил три гола.

В 1996 году за 8,6 миллиона долларов Зеедорф перешел в мадридский «Реал», где в первый же сезон помог «сливочным» выиграть чемпионат Испании.

В сезоне 1997/1998 Кларенс вместе с «Реалом» завоевал второй для себя кубок Лиги чемпионов УЕФА.

На Чемпионате мира 1998 Кларенс в составе Нидерландов занял четвертое место. В матче за третье место сборная Нидерландов уступила сборной Хорватии.

Таких же результатов добился Зеедорф в составе сборной Нидерландов на чемпионатах Европы 2000 и 2004 годов.

В начале 2000 года Зеедорф перешел в итальянскиий «Интер» за 23 млн евро. В «Интернационале» Кларенсу не удалось добиться больших успехов, и в 2002 году он перешел в «Милан».

В «Милане» Кларенс сразу же стал одним из лидеров команды.

В сезоне 2002/2003 Зеедорф помог «Милану» выиграть Серию А и Лигу Чемпионов УЕФА. Победа в Лиге Чемпионов УЕФА сделала Кларенса единственным футболистом в мире, завоевавшим этот трофей с тремя разными клубами.

В сезоне 2004/2005 Кларенс вместе с «Миланом» вновь стал финалистом Лиги Чемпионов УЕФА, но победа досталась английскому «Ливерпулю».

В сезоне 2006/2007 «Милан» вновь стал обладателем кубка Лиги Чемпионов УЕФА, а Кларенс был признан лучшим полузащитником турнира.

В мае 2012 года Кларенс Зеедорф подписал двухлетний контракт с бразильским клубом «Ботафого». В матче «Ботафого» против «Мадурейры» Кларенс впервые в карьере был удалён с поля. Зеедорф пробыл в бразильском клубе до конца 2013 года.

14 января 2014 года Кларенс объявил о завершении карьеры футболиста.

16 января 2014 года Кларенс Зеедорф приступил к обязанностям главного тренера «Милана», с которым подписал контракт до 30 июня 2016 года.