Иван Яковлевич Науменко родился 16 февраля 1925 года в поселке Василевичи, Гомельская область.
В 17 лет Иван Науменко пошел воевать и стал бойцом партизанской бригады имени Пономаренко. Затем участвовал в тяжелых боях на Карельском перешейке, а закончил войну в Восточной Пруссии и Силезии.
В 1950 году Науменко закончил заочное обучение на филологическом факультете Белорусского государственного университета. Затем там же поступил в аспирантуру, после окончания которой заведовал кафедрой белорусской литературы.
В 1955 году Иван Науменко опубликовал свои первые рассказы, «Сидор и Гараська» и «Эх, махорочка», в журнале «Молодость».
В 1957 году вышел первый сборник рассказов Ивана Науменка под названием «Семнадцатой весной», который положил начало выпуску книг автора. Затем последовали такие сборники, как «Хлопцы-ровесники» (1958), «Вереск на пожарищах» (1960), «Тополя юности» (1966), «Вероника» (1968) и другие.
Хорошие отзывы получила трилогия Науменка о партизанской борьбе в тылу немецких оккупантов, в состав которой вошли книги «Сосна при дороге» (1961), «Ветер в соснах» (1966) и «Сорок третий» (1973).
С 1973 по 1982 год Иван Науменко возглавлял Институт литературы имени Я.Купалы Академии наук БССР.
В 1978 Науменко был удостоен звания Заслуженного деятеля науки Белорусской ССР.
С 1982 по 1991 год Науменко занимал пост вице-президента АН БССР.
В 2002 году начал работать главным научным сотрудником Института литературы НАН Беларуси.
Умер Иван Науменко 17 декабря 2006 года.