Остин Грин встречался с актрисой Тиффани-Амбер Тиссен в начале и середине 90-х. После их расставания, он встретил актрису Ваннесу Марсил, также на съемках сериала Беверли-Хиллз, 90210. Их сын, Кассиус Лиджа, родился 30 марта 2002 года.

В 2004 году Грин начал отношения с актрисой Меган Фокс, которые в конечном счете привели к помолвке.

В феврале 2009 году было объявлено о том, что пара разорвала их отношения, однако, In Touch Weekly сообщает, что пара до сих пор вместе.

Их очередная помолвка состоялась 1 июня 2010 года, а 24 июня 2010 года они поженились по сообщению TMZ.com и других сайтов тайком в гостинице «Four Seasons» на Гавайях.

28 марта 2012 года стало известно, что супруги ожидают появления своего первенца. 27 сентября 2012 года у супругов родился сын Ноа Шэннон Грин.

В начале августа 2013 года стало известно, что Меган и Брайан ждут второго ребенка.

13 февраля 2014 года у пары родился сын.

В августе 2015 года в СМИ появилась информация о том, что Брайан Остин Грин и Меган Фокс разводятся.