Аарон Экхарт был помолвлен с актрисой Эмили Клайн, которую встретил на съёмках фильма «В компании мужчин», но в 1998 году они разошлись.

В 2009 году он встречался с МоллиСимс.

Однажды в интервью он признался, что с помощью гипноза бросил пить, курить и проводить время на сомнительных вечеринках.