Микаэл Нюквист родился 8 ноября 1960 года. Закончил Школу Шведской Академической Драмы. После множества ролей в театре начал получать небольшие роли в кино.
Первым большим успехом стал фильм «Вместе» (Tillsammans, 2000) Лукаса Мудиссона. Картина вызвала большой международный интерес, а Нюквист получил главный актерский приз на фестивале в Гижоне.
Далее последовала серия главных ролей в фильмах «Парень из соседней могилы» (Grabben i graven bredvid, 2002), получив за нее эквивалент Оскара - Шведский Гульбагге, «Как на небесах» (Så som i himmelen, 2004), «День и ночь» (Dag och natt, 2004) и «Внезапно» (Underbara älskade - 2006).
Международное признание пришло к Нюквисту, когда он исполнил роль Микаэля Бломквиста в картинах «Девушка с татуировкой дракона», «Девушка, которая играла со огнем» и «Девушка, которая взрывала воздушные замки» – эти три фильма составляют Миллениум-трилогию, придуманную и написанную Стигом Ларсеном.
Нюквист всегда был в первых строчках рейтинга актеров, претендующих на роль Бломквиста, но получил ее только благодаря своему обаянию. Режиссер первого фильма «Миллениум-трилогии» Нильс Арден Оплев нашел в нем все, что ему было нужно: шарм и способность перевоплощаться.
Нюквист был утвержден на главную роль в экранизации романа Хеннинга Манкеля «Человек из Беиджинга». Кроме того, он член постоянной труппы Стокгольмского театра. Также он сыграл одну из главных ролей в фильме Брэда Бёрда «Миссия невыполнима: Протокол Фантом».
В 2011 году снялся в фильме «Погоня».