- Литературная премия Приз Медичи (1996, Франция)

- Литературная премия Приз им. Джузеппе Асерби (1998, Италия)

- Русский Букер (2001)

- Кавалер Ордена Академических пальм (Франция, 2003)

- Премия «Книга года» за роман «Искренне ваш, Шурик» (2004)

- Кавалер Ордена искусств и литературы (Франция, 2004)

- Премия Пенне (2006, Италия) — за роман «Казус Кукоцкого»

- Премия «Большая книга» (2007) — за роман «Даниэль Штайн, переводчик»

- Литературная премия Гринцане Кавур (2008, Италия) — за роман «Искренне Ваш, Шурик»

- Номинация на Международную Букеровскую премию (2009, Англия)

- Литературная премия журнала «Знамя» в номинации «Глобус» (2010) за «Диалоги» Михаила Ходорковского с Людмилой Улицкой, опубликованные в десятом (октябрьском) номере «Знамени» за 2009 год.