В 1981 году актриса Джессика Лэнг родила Михаил Барышникову дочь Александру.

На даный момент Михаил живет с Лайзой Райнхарт, бывшей балериной и внучкой знаменитого немецкого театрального режиссера Макса Рейнхардта. Пара имеет трёх детей: Питер (1989 г.р.), Анна (1992 г.р.) и София (1994 г.р.).