Родился 22 июля 1966 года в доме отдыха "Поленово" Тульской области. Его отец был 62-летним главврачом, а мать — 19-летней студенткой. После окончания школы Охлобыстин поступил во ВГИК. После службы в армии (служил в ракетных войсках в Ростове-на-Дону) восстановился в институте и полностью погрузился в общественную работу. За короткий срок он даже был избран секретарём Союза кинематографистов СССР.
В 1992 году закончил режиссёрский факультет ВГИКа (мастерская Таланкина). Его актёрским дебютом стала картина «Нога» (реж. Н. Тягунов) — он получил приз за лучшую роль на фестивале «Молодость-91». Первый же сценарий Охлобыстина к фильму «Урод» (реж. Р. Качанов) получил номинацию на престижное «Зелёное яблоко, золотой листок». Первая полнометражная режиссёрская работа Охлобыстина — «Арбитр» (с саундтреком групп «Пикник» и «Оберманекен») — получила награду «Кинотавр» в категории «Фильмы для избранных». Также принимал участие в театральных постановках.
В 1995 году он женился на актрисе и модели Оксане Арбузовой, которая родила ему шестерых детей: двоих сыновей и четырёх дочерей.
16 февраля 1996 года во МХАТе состоялась премьера спектакля по пьесе Ивана Охлобыстина «Злодейка, или Крик дельфина» (в постановке М. Ефремова).
Дома у Охлобыстина есть мини-коллекция ружей. Также питает страсть к хорошим часам и мобильным телефонам. Состоит в Союзе охотников и рыболовов России, а кроме того — в Международной ассоциации айкидо кёку рэммэй. Увлекается ювелирным делом. Имеет разряд по шахматам. По политическим убеждениям является монархистом.
Охлобыстин пробовал свои силы в политике. Был членом экологической партии «Кедр», которая шла во власть с целью возродить в России институт монархии.
Свою приверженность к православию Охлобыстин сделал публичным достоянием в 1998 году, став ведущим телепередачи «Канон».
В начале 2001 года вышел фильм «Даун Хаус» с его участием, и в это же время становится известно, что Охлобыстин рукоположен в священники архиепископом Ташкентским Владимиром (Икимом). Произошло это событие в Ташкентской епархии. В конце года Охлобыстин возвратился в Москву, где устроил презентацию своего короткометражного фильма о князе Данииле. Причём это был первый фильм из цикла «Жития святых», в котором должно быть, по задумке Охлобыстина, 477 серий.
В том же 2001 году Президент России Владимир Путин наградил Охлобыстина именными золотыми часами N 239 «За заслуги перед Отечеством».
Сан священнослужителя Охлобыстин принял будучи весьма популярным актёром и сценаристом. Поскольку православие негативно относится к актёрской деятельности, Иван на время оставил эту профессию и выступал только в роли сценариста.
До 2005 года отец Иоанн служил в храме святителя Николая в Заяицком, расположенном на Раушской набережной Москвы-реки. После — в храме Софии Премудрости Божией на Софийской набережной.
Ведёт передачу «Стая» на радиостанции Русская служба новостей. Ведёт колонку в мультимедийном сообществе "Сноб".
В 2005 году вышла его книга «ХIV принцип», написанная в жанре фантастики.
В 2008 году Охлобыстин снова вернулся к актёрской деятельности, объясняя это потребностью заработка.
Гариком Сукачёвым снят фильм «Дом Солнца» по сценарию Охлобыстина.
В фильме «Заговор», который снял режиссёр Станислав Либин, Иван Охлобыстин исполнил роль Григория Распутина.
Сейчас Охлобыстин снова активно включился в съёмочный процесс. В 2009 году вышли сразу несколько фильмов с его участием: «Пуля-дура», состоялась премьера фильма «Царь».
26 ноября 2009 года в новостных лентах появилось сообщение о том, что Охлобыстин попросил Патриарха Кирилла освободить его от служения из-за «внутренних противоречий».
8 февраля 2010 года Патриарх Кирилл, по просьбе самого Ивана Охлобыстина, отстранил его от священнослужения, запретив ношение священнических одежд и иерейского креста. Патриарх отметил, что если священник Иоанн Охлобыстин сделает «окончательный и однозначный выбор в пользу пастырского служения», то его временное запрещение в служении может быть снято.
В 2010 году с участием Охлобыстина вышли фильмы «Ирония любви», «Глухарь. «Снова Новый!», «Поцелуй сквозь стену», «Суперменеджер, или Мотыга судьбы» и «Колокол», а также сериал «Интерны», в котором он играет заведующего терапевтическим отделением Андрея Евгеньевича Быкова.
Затем Иван снялся в таких фильмах как «Служебный роман. Наше время» (2011), «Generation П» (2011), «Мой парень – ангел» (2011), «Соловей-Разбойник» (2012), а также сыграл главную роль в сериале «Метод Фрейда» (2012).
Весной 2013 года Охлобыстин вместе с Кристиной Асмус были отмечены народными премиями «Телезвезда-2012» и «Жорж-2013» как «Лучшие актер и актриса года».
В апреле 2013 года стало известно о том, что Иван собирается покинуть профессию актера и вернуться к церковному служению. Но только после того как снимется во всех запланированных раннее фильмах.
↑ свернуть