Семен Семенович Школьников родился 14 января 1918 года в Москве. В шестнадцать лет окончил ремесленное училище (ФЗУ), работал на заводе «Серп и Молот» слесарем четвертого разряда. Однажды его старшая сестра, которая работала на кинофабрике, предложила Семену пойти к ним слесарем по ремонту киноаппаратуры. Год занимался ремонтом киноаппаратуры. Потом его привлекла работа кинооператора.
Когда в 1935 году освободилось место, Школьникова взяли помощником оператора. Одновременно с работой на студии, с 1935 года, Семён учился в Институте повышения квалификации творческих работников при ВГИКе. Институт окончил в 1939 году.
Со своим киноапппаратом Школьников много путешествовал, снимал моменты строительства канала Москва-Волга, побывал на отправке первого рейса советского ледокола в Арктику, был в Средней Азии и на Новой Земле. Снял документальные фильмы "Народные мстители", "Освобождение Советской Белоруссии", "Встречи в Копенгагене", "Там, где жил Хемингуэй". Постановщик художественного фильма "Украли старого Тоомаса".
После войны Школьников некоторое время работал оператором и режиссёром Центральной киностудии документальных фильмов. В 1946 году он переехал к супруге в Таллин, где с 1948 года работал на киностудии "Таллинфильм", там же снимал документальные фильмы о республике.
Школьников является лауреатом Сталинской премии 1943, 1947 и 1951 годов, а также лауреат национальной премии Российской Академии кинематографических искусств «Ника».
Награжден орденами Боевого Красного Знамени, Отечественной войны 1 и 2 степеней, Знак Почета, Дружбы народов, югославским орденом «За заслуги перед народом», многими медалями.