Кюдзо Мифунэ родился 21 апреля 1883 года, в Кудзи, префектура Иватэ, на острове Хонсю, Япония. Кюдзо Мифунэ был одним из лучших учеников Кано Дзигоро, причём многие считали, что в техническом плане он даже превосходил своего учителя. Кюдзо Мифунэ называли «Богом дзюдо». О стиле Кодокан дзюдо в то время даже говорили: «теория Кано, практика Мифунэ». Одним из коронных приёмов Мифунэ был бросок суми-отоси (букв. «сбрасывание во внутренний угол», выведение из равновесия толчком назад)

В 1903 году Кюдзо Мифунэ приступил к занятиям в Кодокане и через 15 месяцев уже получил 1-ый дан по дзюдо. Далее через рекордно короткий срок 4 месяца ему был присвоен 2-ой дан. Благодаря прекрасным скоростным качествам и чувству времени, Мифунэ очень быстро прогрессировал; он ни разу не потерпел поражения в традиционных ежегодных соревнованиях, проводимых в Кодокане.

К 1912 году Кюдзо Мифунэ достиг уровня 6-ого дана и получил звание инструктора.

Именно в это время его стали называть «Богом дзюдо». В последующие 20 лет слава Кюдзо Мифунэ как выдающегося борца только росла. Когда Мифунэ было 40 лет, ему бросил вызов борец сумо, ростом около 190 см и весом около 100 кг. Но Мифунэ, который в то время весил менее 50 кг, всё же победил его при помощи одного из своих любимых бросков — уки-отоси (букв. «сбрасывание скольжением по поверхности», выведение из равновесия скручиванием (сбрасывание по касательной).

В 1937 году Кано присвоил Кюдзо Мифунэ 9-ый дан. После смерти Кано в 1938 году Мифунэ стал наиболее влиятельным инструктором в Кодокане. 25 мая 1945 года Кюдзо Мифунэ был присвоен 10-ый дан, и он стал четвёртым из дзюдоистов удостоенных такого уровня признания.

В 1956 году Мифунэ написал книгу «Канон дзюдо», ставшую классической, и до сих пор являющуюся выдающимся произведением по истории, философии и технике дзюдо.

В 1964 году Кюдзо Мифунэ, в знак признания его выдающихся заслуг в деле пропаганды и развития дзюдо, был награждён японским орденом Восходящего солнца. Мифунэ активно продолжал участвовать в развитии дзюдо вплоть до самой своей смерти.

В 1964 году, уже будучи больным раком горла, он принимал участие в организации Олимпийских игр в Токио, в программу которых впервые было включено дзюдо.

В декабре 1964 года он был помещён в госпиталь, где скончался 27 января 1965 года в возрасте 81 года.

На момент своей кончины он оставался единственным из живущих дзюдоистов с 10-ым даном Кодокан дзюдо. В память о Кюдзо Мифунэ в его родном городе Кудзи сооружёны мемориал, музей и спортивный комплекс.