С первой женой, актрисой Еленой Новиквой Егор Баринов познакомился в то время, когда он работал в Театре имени Пушкина. Это была любовь с первого взгляда. Молодые люди сразу же решили пожениться. Позже оба поняли, что к семейной жизни они не готовы, поэтому через два года супруги подали на развод. А немного позже выяснилось, что Елена беременна. Ребенка решили оставить, но все равно развелись.

Елена родила сына Данилу.

Егор с сыном очень редко видятся, а мальчика воспитывает новый муж Елены.

Со второй женой Ксенией Мишиной Егор Баринов познакомился, когда работал в Малом театре. В то время она была еще студенткой Щепкинского училища и приходила в театр играть в массовке. Спустя четыре года после знакомства Егор и Ксения поженились.

В 2007 году, через год после их свадьбы у пары родилась дочь Полина.

А 2 января 2013 года в актерской семье появилась вторая дочь Анастасия.