Марк Рудинштейн родился 7 апреля 1946 года в Одессе. Родители Марка Рудинштейна: Тауба Исааковна и Израиль Григорьевич. Трудовую деятельность начал в 15 лет на судостроительном заводе в Николаеве. После — служил в армии.
Учился в ГИТИСе (не окончил), затем в 1972—1976 годах учился на очно-заочном отделении в Театральном училище им. Б. Щукина (мастерская М. Тер-Захаровой).
В период с 1982 по 1987 годы Рудинштейн находился либо в тюрьме, либо под следствием. Был осужден за «дачу взяток» и «расхищение социалистической собственности» на 6 лет, отсидел 11 месяцев, после чего был оправдан.
Был организатором первого в СССР рок-фестиваля, прошедшего в Подольске в «Зелёной эстраде» в сентябре 1987 года.
В 1989—1991 годах генеральный директор кинодистрибюторской фирмы «Подмосковье». В 1994 году Марк Рудинштейн пытался воссоздать кинофестиваль «Золотой Дюк».
Состоит в третьем браке. Имеет дочь Наталью от первого брака.