12 июня 2008 года Уэйн Руни женился на своей подруге Колин Маклафлин.
2 ноября 2009 года у пары родился сын Каи Уэйн Руни.
21 мая 2013 года у Колин и Уэйна родился второй сын Клей Энтони Руни.