Себастьен Ожье родился 17 декабря 1983 года на юго-востоке Франции в городе Гап.

Так как семья Ожье проживает возле трассы легендарного ралли Монте-Карло, то Себастьен с раннего детства начал увлекаться гонками.

В возрасте 8 лет Себастьен впервые сел за руль подаренного ему кросс-карта.

После окончания школы Ожье стал работать лыжным инструктором, а позже механиком в раллийной команде Peugeot Sport.

В 2006 году Ожье в качестве пилота принимает участие в соревнованиях Peugeot 206 Cup и занимает 6 место, а в 2007 году становится победителем этих соревнований.

В 2008 году гонщик стал победителем Чемпионат мира по ралли среди юниоров, где выступал за команду Equipe de France FFSA.

В 2009 году Себастьен Ожье подписал контракт с командой WRC Citroën Junior Team.

Дебютной гонкой на Чемпионате мира по ралли для Ожье стала гонка в Ирландии, в которой он занял шестое место. Самой удачной гонкой для Себастьена Ожье в этом сезоне стала гонка в Акрополисе, где гонщик показал второй результат. В итоге сезон француз окончил на 8 месте.

В сезоне 2010 года Себастьен завоевал одно первое, одно второе и два третьих места выступая за Citroën Junior Team, а также одно первое и одно второе за команду Citroën Total WRT. По итогам сезона Ожье стал четвертым.

Весь 2011 год французский гонщик отъездил в составе Citroën Total WRT, где его партнером был Себастьен Леб. За сезон Ожье пять раз становился первым, а также дважды приходил третьим. С таким результатом Себастьен стал третьим по итогам сезона, пропустив вперед лишь Микко Хирвонена и Себастьяна Леба (первое место).

В 2012 году Ожье перешел в команду Volkswagen Motorsport, где стал ездить на Škoda Fabia S2000. За весь сезон гонщик ни одного раза не смог приехать раньше пятого места и в итоге стал шестым в общем зачете.

В 2013 году Себастьен пересел на Volkswagen Polo R WRC и в первой же гонке стал вторым, пропустив вперед лишь Леба. Затем последовала серия побед на гонках в Швеции, Мексике и Португалии. Всего за сезон из тринадцати гонок, Ожье лишь в четырех не пришел первым. В итоге Себастьен завоевал свой первый титул чемпиона мира.

В 2014 году Ожье не стал менять автомобиль и в первой же гонке в Монте-Карло завоевал победу.