Актер был женат несколько раз. Его первой супругой стала английская актриса Аннет Робертсон, брак длился с 1962 по 1964 год. Долгие отношения были у Джона с французской моделью Мари-Лиз Волпелье-Пирро. Их роман длился 15 лет, но в 1983 году Мари-Лиз трагически погибла.

В конце 1984-го Джон Хёрт женился во второй раз, его избранницей стала техасская актриса Донна Пикок. Супруги несколько лет пытались завести детей и даже прибегали к помощи экстракорпорального оплодотворения, но безуспешно. С Донной Джон развелся в январе 1990-го, а спустя всего несколько дней женился вновь, на ассистентке режиссера Джо Далтон. В браке родилось двое сыновей, но и это не уберегло пару от развода, состоявшегося в 1996 году.

В марте 2005-го 65-летний Джон Хёрт женился в четвертый раз. Его супруга – рекламный продюсер Анвен Рис Мейерс.