Родился в провинциальном городке Коттэдж Грув, который расположен в штате Миннесота (США), в многодетной семье. Родители очень любили младшего сына и потакали всем его прихотям, а Шон рос в окружении братьев и сестер. С раннего детства мальчик был очень активным и любознательным ребенком. Так случилось, что в юности он устроился работать в кинотеатр, и это событие произвело на него неизгладимое впечатление. Благодаря возможности бесплатного просмотра фильмов, Шон за некоторое время пересмотрел все самые значимые картины и решил, что непременно должен стать актером. Позже в одном из интервью актер признался: «Я никогда не участвовал в школьной самодеятельности, не играл в домашних спектаклях. Но мысль, что моя игра может понравиться друзьям и родителям, меня возбуждала невероятно. Я верил в собственные исключительные силы и успех!». И это чутье не подвело молодого амбициозного парня, но ему пришлось пройти тернистый путь к славе.

Достигнув совершеннолетия, Шон Уильям Скотт отправился, как и тысячи тысяч молодых людей, покорять заветный Голливуд. По началу начинающему актеру катастрофически не везло: ему приходилось работать с утра до вечера на разных работах, чтобы обеспечить свое существование в городе грез. Но Шон не унывал и даже после неудачного прослушивания в сериале «Все мои дети», верил, что его час еще придет. Так молодой непрофессиональный актер устроился работать на телевидение, в комедийное шоу «Несчастливы вместе».

Кроме этого актер не чурался и подработкой в рекламе: так Шон снялся в рекламном ролике для «American Express» и засветился в видеоклипе «Hole In My Soul» популярной американской рок-группы Aerosmith.

В 1997 годуШон Уильям Скотт дебютировал на телевидении в драме «Рожденный в ссылке», а в 1998 году принял участие в комедийном шоу «Нечто очень правильное» («Something So Right»).

Настоящий успех пришел к Шону с ролью Стива Стифлера в молодежной комедии «Американский пирог», которая вышла на экраны в 1999 году. Шон блестяще сыграл роль высокомерного старшекурсника, который пользовался большой популярностью у девушек и издевался над приятелями, которые отчаянно пытались потерять девственность до окончания школы. После выхода этой картины на экраны, Шон проснулся знаменитым, а имя «Стифлер» стало практически нарицательным для американской молодежи тех лет. По признанию самого актера, роль Стифлера получилась настолько удачной потому, что он копировал своих школьных дружков, которые вели себя примерно также как герой в этом фильме. После этого актера пригласили сниматься в фантастический триллер «Пункт назначения», который также имел большой успех у публики.

Затем актер снялся в таких фильмах, как: «Американский пирог — 2» (2001), в фантастическом фильме «Эволюция» (2001), «Бесшабашное ограбление» (2003), «Придурки из Хаззарда» (2005), «Сказки юга» (2006), «Взрослая неожиданность» (2008), «Двойной КОПец» (2010).

Роль Стифлера в какой-то мере сузила возможные амплуа актера, потому что продюсеры во что бы то ни стало хотели видеть на площадке разухабистого высокомерного типа, а не серьезного драматического актера, поэтому вскоре Шон Уильям Скотт спокойно отнесся к предложениям сняться в продолжении «Американского пирога» и других похожих комедий. Актер признается:

«Не имеет значения, хороший ли получился фильм и как вы в нем сыграли. Если он делает кассу, то перед вами открываются новые возможности».

Картина «Взрослая неожиданность», которая вышла на экраны в 2008 году, вернула Шона в комедийный жанр. Эта история о том, как герой Скотта, разгильдяй и оболтус, однажды нарушает закон и чтобы не сесть в тюрьму, приговаривается судом к исправительным работам. Исправлять ему пришлось малолетнего хулигана, который несмотря на ангельскую внешность, разогнал всех своих предыдущих наставников непредсказуемыми поступками. Сам актер так отзывается о фильме:

«Это история о мальчике, который с помощью сквернословия пытается приспособиться к окружающему миру. Уилер поступает по отношению к нему как истинный наставник; переборов самого себя, он сближается с пареньком, становится его другом и помогает ему вылезти из его раковины, смягчая его внутреннюю защитную броню...»

О личной жизни молодого человека известно мало: он предпочитает не заводить романов с актрисами. Известно, что Шон пишет автобиографию и хочет заняться сценариями в будущем. Кроме этого, актер мечтает все-таки осуществить свою давнюю мечту и сняться в каком-нибудь интересном независимом проекте, но это только в перспективе.