Фёдор Бондарчук состоит в браке со Светланой Бондарчук, главным редактором журнала «HELLO!».

Их первая встреча произошла в 1986 году в гостях у общей знакомой, во время службы Фёдора в армии. Светлана (на тот момент ещё носившая фамилию Рудская) сразу привлекла его внимание.

Спустя полтора года, когда служба уже близилась к концу, Фёдор попал в больницу с травмой ноги. И будучи постоянно в мыслях о той самой девушке, попросил свою школьную подругу привести её к нему в больничную палату, что в скором времени и случилось. С этого момента и начинается отсчет счастливого и прочного союза Фёдора и Светланы Бондарчук, результатом которого стало появление двух детей: сына Сергея и дочери Варвары.