Родилась 25 марта 1974 года в Ленинграде. Окончила Санкт-Петербургскую академию театрального искусства в 2000-м году, после чего сразу же была приглашена в Санкт-Петербургский Малый драматический театр. Раппопорт – одна из выдающихся учениц великого режиссера Льва Додина. Она долгое время была известна исключительно театральной публике, однако чуть позже снялась в нескольких сериалах.

Ксения любима итальянской публикой – была признана лучшей актрисой года за роль в ленте Джузеппе Торнаторе "Незнакомка". Сейчас Раппопорт продолжает сниматься в итальянском кино. В частности, на ее счету роль в фильме "Человек, который любит". В нем она снялась вместе с Моникой Белуччи.

Одна из последних ее работ – нашумевший фильм Кирилла Серебренникова "Юрьев день". За него Раппопорт была отмечена призом за лучшую женскую роль фестиваля "Кинотавр".

В 2009 году на Венецианском кинофестивале Ксения была награждена Кубком Вольпи за лучшую женскую роль (в итальянском триллере "Двойной час").

В 2011 г. снимается в фильме Жозе Дайан «Распутин».