Мать Рафаэля — испанка, отец — голландец.
10 июня 2005 года Рафаэль женился на Сильвии Мейс, голландской актрисе и телеведущей. 27 мая 2006 года у них родился первый ребёнок, сын Дэмиан Рафаэль.