С 1991 по 2001 год Мег Райан была замужем за актёром Дэннисом Куэйдом. 24 апреля 1992 года у них родился сын Джек Генри Куэйд.

В январе 2006 года Мег удочерила девочку из Китая — Дейзи Тру (родилась в 2004 году).

В 2010 году Мег начала встречаться с музыкантом Джоном Мелленкампом.

В январе 2014 года пара рассталась. Джон просил Мег переехать к нему в Индиану, где у него есть дом, но актриса не согласилась покидать Нью-Йорк, а музыкант не захотел жить в мегаполисе.