Родился в Токио 21 февраля 1951 года. Закончил Дартмур-Колледж и Йельский университет.
В 1981 году основал свою мастерскую "William McDonough + Partners" в Нью-Йорке.
Считается одним из ведущих архитекторов, занимающихся проектированием "зеленых" сооружений, в том числе - промышленных.
В числе его работ - крупные проекты для корпоративных клиентов The Gap, Nike и Herman Miller, а также - 20-летний план по превращению старейшего завода Ford в Ривер Руж (штат Мичиган) в экологически чистое, ресурсосберегающее производство.
В его рамках в 2002 году перекрытия предприятия стали самой большой в мире "зеленой крышей" площадью 40 000 кв. м.