Харрис — открытый гей, совершил камин-аут в ноябре 2006 года. Его партнер — актёр Дэвид Бартка, в частности, сыграл эпизодическую роль в сериале «Как я встретил вашу маму». Летом 2010 года пара объявила, что ожидает появление двойняшек от суррогатной матери. 12 октября 2010 года двойняшки, девочка Харпер Грейс и мальчик Гидеон Скотт, появились на свет.

Харрис — фанат магии и фокусов, и он также иллюзионист, как и его персонаж в сериале «Как я встретил вашу маму».